韦德体育 -“一站式”分析平台猪多组学整合数据库发布—新闻—科学网

作者 :

2025-04-21 14:46:26

近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技能广东省试验室深圳分中央）、佛山鲲鹏现代农业研究院研究员唐中林团队于《基因组卵白质组与生物信息学报》（Genomics, Proteomics Bioinformatics）发表了论文。该研究发布了猪整合多组学数据库PIGOME（https://pigome.com），为猪功效基因组研究与份子育种提供了“一站式”阐发平台。

猪不仅是我国住民最重要的动物卵白来历，也是人类发育及疾病的主要模子。近二十年来，跟着高通量测序技能的快速成长，孕育发生了海量的多组学数据，这些数据来历在猪的差别品种、发育阶段及构造，有助在猪的进化、繁杂性状形成及疾病等研究。然而，这些数据来自在差别试验室及测序平台，存于检索坚bevictor伟德官网苦、治理分离、数据处置惩罚不同一及可视化坚苦等问题。怎样深切挖掘并整合阐发大众数据面对很年夜的挑战。针对于这些问题，研究职员开发了PIGOME数据库：一个猪综合性多组学整合数据库。

据悉，PIGOME数据库包罗来自392个项目的6901个猪的样本，触及113个品种、71个构造及29个发育阶段的7种差别类型的组学数据，同时整合了年夜量解释信息及阐发东西。PIGOME为用户提供了友爱的界面，可经由过程交互式网页、强盛的搜刮引擎及高级东西阅读及阐发组学数据。整合的基因组、转录组及表不雅基因组数据为发明猪主要经济性状及人类相干疾病相干的靶基因及位点提供了一种快捷有用的要领。PIGOME为猪的功效基因组学研究提供了主要平台，对于动物遗传学、育种及生物医学研究等范畴具备主要价值。

唐中林、基因组所（年夜鹏湾试验室）副研究员杨亚岚为论文配合通信作者。基因组地点读博士生韩郭皓（原科研助理）、基因组所及河南年夜学结合造就硕士生杨朋（已经卒业）为论文配合第一作者。该研究获得国度重点研发规划、国度天然科学基金、深圳市科技庞大专项及中国农业科学院立异工程等的资助。

相干论文信息：https://doi.org/10.1093/gpbjnl/qzaf016

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